江蘇、重慶等地創(chuàng)造性地制定基本藥物集中采購以及供貨企業(yè)誠信度考核評價辦法和月監(jiān)測評價系統(tǒng)，規(guī)范供貨行為。

實行基本藥物制度、取消藥品加成后，各地制定具體補償辦法，明確補償標準，落實各方責任，初步建立起穩(wěn)定、長效的基層醫(yī)療衛(wèi)生機構(gòu)補償機制。

江蘇省對經(jīng)濟薄弱地區(qū)基層醫(yī)療衛(wèi)生機構(gòu)按核定的經(jīng)常性收支差額的1/3給予補助，對村衛(wèi)生室按每個行政村1萬元給予補助。無錫市將政府辦基層醫(yī)療衛(wèi)生機構(gòu)納入財政預算，全面實施收支兩條線管理。據(jù)統(tǒng)計，今年無錫市縣財政預算共安排經(jīng)常性收支差額補助資金45億元，1月~6月累計撥付19.5億元，撥付比例為43%。

云南省基層醫(yī)療衛(wèi)生機構(gòu)收支補償工作按照“一縣一策” 制定出臺本地補償辦法，落實政府對基層醫(yī)療衛(wèi)生機構(gòu)的專項補助以及經(jīng)常性收支差額的補助。截至今年1月底，全省105個縣落實了政府辦基層醫(yī)療衛(wèi)生機構(gòu)的專項補助以及經(jīng)常性收支差額的補助，占81.40%，截至今年5月底，全省共有14個州市、112個縣市區(qū)出臺了基層醫(yī)療衛(wèi)生機構(gòu)補償實施意見和辦法。具備條件的地區(qū)還實行“收支兩條線”，確保了補償資金及時足額到位。

上海市社區(qū)衛(wèi)生服務(wù)中心全面實施了收支兩條線管理，社區(qū)衛(wèi)生服務(wù)中心的正常運行與公益性得到充分保障。財力困難區(qū)縣所需經(jīng)費結(jié)合市財政下達的一般性轉(zhuǎn)移支付“醫(yī)療衛(wèi)生”大類資金予以統(tǒng)籌安排。四川攀枝花市對各縣（區(qū)）實施國家基本藥物制度的城市社區(qū)和鄉(xiāng)鎮(zhèn)的常住總?cè)丝?，按每人每?元的標準安排預算，高于規(guī)定標準。

從2011年1月1日起，在“預算管理權(quán)不變、資金所有權(quán)和使用權(quán)不變、財務(wù)審批權(quán)不變、債權(quán)債務(wù)關(guān)系不變”的前提下，海南省對鄉(xiāng)鎮(zhèn)衛(wèi)生院實行市縣級財務(wù)集中管理。海口市、瓊海市正在探索實施基層醫(yī)療衛(wèi)生機構(gòu)財務(wù)收支兩條線管理。

一些地方積極探索城鄉(xiāng)居民醫(yī)保一體化管理。目前，海南三亞市城鄉(xiāng)居民醫(yī)保實現(xiàn)了一體化管理。吉林長春市朝陽區(qū)和吉林市船營區(qū)已經(jīng)實現(xiàn)了新農(nóng)合與居民醫(yī)保的城鄉(xiāng)統(tǒng)籌工作，初步構(gòu)建了基本醫(yī)療保障的城鄉(xiāng)統(tǒng)籌。